MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN6

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009652	ACA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973831
2	NC_009652	CTG	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973831
3	NC_009652	CTTGAT	2	12	251	262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152973831
4	NC_009652	GAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973831
5	NC_009652	AAC	2	6	408	413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973832
6	NC_009652	TTAA	2	8	424	431	50 %	50 %	0 %	0 %	152973832
7	NC_009652	CTG	2	6	575	580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973832
8	NC_009652	CTT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973832
9	NC_009652	TGG	2	6	733	738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973832
10	NC_009652	A	6	6	748	753	100 %	0 %	0 %	0 %	152973832
11	NC_009652	GGTA	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	152973833
12	NC_009652	AAT	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
13	NC_009652	GCT	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973834
14	NC_009652	TAG	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
15	NC_009652	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	152973834
16	NC_009652	AAAATA	2	12	1778	1789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	152973834
17	NC_009652	TCA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973834
18	NC_009652	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973834
19	NC_009652	GTT	2	6	1982	1987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973834
20	NC_009652	ATA	2	6	2027	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
21	NC_009652	A	8	8	2048	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	152973834
22	NC_009652	AAT	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
23	NC_009652	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973834
24	NC_009652	TTTA	2	8	2161	2168	25 %	75 %	0 %	0 %	152973834
25	NC_009652	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
26	NC_009652	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
27	NC_009652	GTA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
28	NC_009652	TTG	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973834
29	NC_009652	TGA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
30	NC_009652	AATATA	2	12	2390	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
31	NC_009652	A	7	7	2423	2429	100 %	0 %	0 %	0 %	152973834
32	NC_009652	GAGC	2	8	2474	2481	25 %	0 %	50 %	25 %	152973834
33	NC_009652	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973834
34	NC_009652	TC	4	8	2594	2601	0 %	50 %	0 %	50 %	152973834
35	NC_009652	AT	4	8	2634	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	152973834
36	NC_009652	TAC	2	6	2648	2653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973834
37	NC_009652	TAA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
38	NC_009652	TGA	2	6	2680	2685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
39	NC_009652	TAA	2	6	2806	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
40	NC_009652	AAT	2	6	2815	2820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
41	NC_009652	GATTT	2	10	2876	2885	20 %	60 %	20 %	0 %	152973834
42	NC_009652	T	6	6	2883	2888	0 %	100 %	0 %	0 %	152973834
43	NC_009652	ATG	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
44	NC_009652	CTTTT	2	10	2967	2976	0 %	80 %	0 %	20 %	152973834
45	NC_009652	TTA	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973834
46	NC_009652	AGA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973834
47	NC_009652	TAAA	2	8	3073	3080	75 %	25 %	0 %	0 %	152973835
48	NC_009652	TGTTT	2	10	3083	3092	0 %	80 %	20 %	0 %	152973835
49	NC_009652	GTT	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973835
50	NC_009652	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973835
51	NC_009652	CAAG	2	8	3223	3230	50 %	0 %	25 %	25 %	152973835
52	NC_009652	A	7	7	3380	3386	100 %	0 %	0 %	0 %	152973835
53	NC_009652	ATC	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973835
54	NC_009652	TAAT	2	8	3445	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	152973835
55	NC_009652	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973835
56	NC_009652	TGA	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973835
57	NC_009652	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973835
58	NC_009652	TGC	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973835
59	NC_009652	AG	3	6	3579	3584	50 %	0 %	50 %	0 %	152973835
60	NC_009652	ATGA	2	8	3603	3610	50 %	25 %	25 %	0 %	152973835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.